На основании постановления Правительства Республики Таджикистан от 1 октября 2008 года за № 491 о реорганизации Государственного унитарного авиационного предприятия «Таджик Эйр» было создано ГУП «Таджикаэронавигация», которое в соответствии с уставом предприятия открыло свои филиалы в городах Худжанд, Куляб и Бохтар.
В настоящее время филиал, как и главный центр предприятия, обеспечивает аэронавигационное обслуживание внутренних, региональных и международных маршрутов через сектор обслуживания воздушного движения, службу радиотехнического обеспечения полетов и авиационной электросвязи и отдел метеорологических станций гражданской авиации. Деятельность данного сектора и отделов заключается в основном в обеспечении безопасности полетов, обеспечении работы радиотехнических и коммуникационных средств и оборудования, техническом обеспечении диспетчерского и авиационного оборудования, техническом использовании метеорологического оборудования, монтажных работах, ремонте и обслуживании технического оборудования филиала, а главное, безопасности полетов, ремонт и поддержании технического оборудования филиала в исправном состоянии, обеспечении мониторинга ветра и погоды для обеспечения безопасности, посадки и взлета самолетов в аэропорту Бохтар.